Новая библиотека для скрининга кристаллографических фрагментов
Новая библиотека для скрининга кристаллографических фрагментов
Опубликовано: 2 месяца назадДобавить в избранное

Новая библиотека для скрининга кристаллографических фрагментов

Чтобы ускорить систематическую разработку лекарств, команда MX (MX - макромолекулярная кристаллография) из Берлинского центра материалов и энергии имени Гельмгольца (HZB) и группа Drug Design Group из Университете Марбурга создали новую библиотеку веществ. Она состоит из 1103 органических молекул, которые могут быть использованы в качестве строительных блоков для новых лекарств. Библиотека доступна для исследователей по всему миру, и может играть роль в поиске активных веществ против SARS-CoV-2.
020

Чтобы ускорить систематическую разработку лекарств, команда MX (MX - макромолекулярная кристаллография) из Берлинского центра материалов и энергии имени Гельмгольца (HZB) и группа Drug Design Group из Университете Марбурга создали новую библиотеку веществ. Она состоит из 1103 органических молекул, которые могут быть использованы в качестве строительных блоков для новых лекарств. Библиотека доступна для исследователей по всему миру, и может играть роль в поиске активных веществ против SARS-CoV-2.


Несколько лет команда MX и группа Drug Design Group работала над созданием библиотеки фрагментов – небольших органических молекул, с помощью которых можно исследовать и картировать функционально важные полости на поверхности белков. Кристаллы белка насыщаются фрагментами и затем анализируются с помощью мощного рентгеновского света. Это позволяет получать трехмерную структурную информацию на уровнях атомного разрешения.


Кроме того, можно выяснить, насколько хорошо конкретный фрагмент молекулы присоединяется к белку-мишени.

Команда MX опубликовала проект библиотеки под названием «F2X-Universal», в нее вошли 1103 соединений. Чтобы подтвердить эффективность библиотеки, то есть чтобы понять, что с ее помощью действительно можно найти необходимые фрагменты, была сделана выборка F2X Entry Screen (репрезентативная выборка составила 96 соединений), которая была протестирована на рентгеновском источнике MAX IV в городе Лунде (Швеция), и на BESSY II.


На выборке был проведен скрининг эндотиапепсина и белкового комплекса Aar2 / RnaseH в качестве целевых ферментов. Исследователи получили 30% совпадений при сравнении с эндотиапепсином и 21% - с белковым комплексом Aar2 / RNaseH.


На следующем этапе команда MX планирует использовать всю новую библиотеку для поиска и скрининга активных веществ.

Обсуждение статьи и ответы экспертов.

Оставьте свой комментарий.